R et Rstudio peuvent être ouverts en même temps, mais en réalité il n’est pas nécessaire d’ouvrir R pour travailler sous Rstudio.
Pour commencer installons un “environnement de travail” basique. Pour cela il faut installer un certain nombre de packages qui permettent d’utiliser des fonctionnalités particulières, comme cela est évoqué dans l’introduction du volume ‘R for Data Science’.
Avant notre première session de travail, il faudrait installer les packages suivants:
install.packages("tidyverse")
install.packages("knitr")
install.packages("rmarkdown")
install.packages("bookdown") # notez les guillemets avec la fonction install.packages()Pour cela, copiez ces commandes telles quelles dans la fenetre haut gauche de R studio et exécutez-les une par une en utilisant les touches suivantes :
CTRL + Entrée sur PC
Command (or Cmd) ⌘ + ↵ Return sur mac
Les packages seront installés définitivement dans R studio.
Pour les utiliser il faudra exécuter les lignes de code suivantes:
library(tidyverse)
library(knitr)
library(rmarkdown)
library(bookdown) # notez l'absence de guillemet avec la fonction library()Les packages devront être activés à chaque début de session R avec ces mêmes commandes.
Pour prendre en main R, voir toute l’introduction de R for Data Science par Hadley Wickham et Garrett Grolemund, notamment pour les activités proposées à partir des dataframes (jeux de données en table) directement insérés dans les packages, tel que mpg dans ggplot2 (ggplot2::mpg). Il y est expliqué ce qu’est un dataframe, comment l’explorer, le manipuler, et produire des visualisation des données qu’il contient.